Krajská archeologická komise je poradní orgán ředitele NPÚ, ÚOP v Brně. Její hlavní činností je projednání návrhů a schválení finančních dotací z Programu podpory záchranných archeologických výzkumů MK ČR.  

Komise posuzuje návrhy na prohlášení nebo rušení prohlášení věcí za kulturní památku na základě žádosti Ministerstva kultury ČR o odborné vyjádření, dále z podnětu orgánů samosprávy, jiných kulturních a společenských organizací nebo případně též indiviudálních fyzických či právnických osob, nebo z vlastního podnětu.

Interní komise NPÚ, ÚOP v Brně se zřizuje v souladu s příkazem ředitele č. 2/2016 jako specializovaný poradní orgán ředitele, zabezpečující objektivitu rozhodování a transparentnost posuzování složitých a společensky sledovaných záměrů obnovy v působnosti územního odborného pracoviště.

Památková rada je vrcholným specializovaným poradním orgánem pro posuzování nejsložitějších odborných otázek státní památkové péče na teritoriu Jihomoravského kraje.

Památková rada se vyjadřuje jak k základním koncepčním, teoretickým a metodickým otázkám památkové péče, tak k jednotlivým mimořádně významným akcím konzervace a restaurování památek, případně k urbanistickým zásahům a novostavbám v památkově chráněných územích.

Ediční rada NPÚ, ÚOP v Brně byla zřízena jako odborný poradní orgán pro posuzování odborné ediční a publikační činnosti.

Ediční rada sestavuje, projednává a doporučuje ke schválení Ediční plán NPÚ, ÚOP v Brně. Připravuje a předkládá řediteli návrhy týkající se koncepce, organizace a náplně odborné ediční činnosti.